Het is het jaar 2034.
Onder de ruïnes, in de metrotunnels van het post-apocalyptische Moskou, wordt wat over is van de mensheid geteisterd door dodelijke dreigingen van buitenaf - en van binnenuit. De catacomben onder de verlaten oppervlakte en de krioelen met mutanten, maar ook in de giftige buitenlucht jagen ze de mensheid op.
Maar in plaats van samen te werken, zijn de stationsteden van de Metro verwikkeld in een verhitte strijd om de ultieme macht, een alles vernietigend wapen uit de militaire opslag van D6. Een burgeroorlog zou de laatste resten van de mensheid uit kunnen roeien.
Jij speelt Artyom, verscheurd door schuldgevoel maar gedreven door hoop, en je bent de sleutel tot onze overleving - onze laatste hoop in duistere dagen...